CdL BiotecnologieCorso di Biologia Molecolare
Lezioni:
Giovedì ore 11-13 Paolo Arosio
Esercitazioni
Venerdì ore 9-11 Isabella Zanella
Esame: test scritto, discussione orale
CdL Biotecnologie
Corso di Biologia Molecolare
Lezioni:
Giovedì ore 11-13 Paolo Arosio
Esercitazioni
Venerdì ore 9-11 Isabella Zanella
Esame: test scritto, discussione orale
Libri
Molecular cell Biology, Lodish e coll.
Molecular Biology of the Cells, Alberts e coll
Genes, Lewin
BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, WATSON James D e coll. zanichelli ed-
Biologia Molecolare
La biologia molecolare studia le funzioni biologiche a livello molecolare delle macromolecole informazionali
Scopo del corso: studiare le conoscenze delle macromolecole e dei meccanismi molecolari che sono alla base della conservazione, riparazione, duplicazione e trascrizione degli acidi nucleici, della maturazione dei trascritti, degli eventi post trascrizionali nella sintesi delle proteine, e del loro targeting in sistemi procarioti ed eucarioti. Tali conoscenze potranno essere usate in applicazioni biotecnologiche.
Le molecole
Carboidrati
lipidi
Proteine
Acidi nucleici
Proteine: Legame peptidico
Ordini di struttura
Alfa elica
beta
Amino acid chemical modifications
Lys: acetylation, methylation
Arg: methylation
Ser and Thr: phosphorylation, acylation, O-linked gkycosylation
Tyr; sulfation, phosphorylation,
Cys: acylation
Asn: N-glycosylation
Le basi Tautomeria delle basi:
Ammino –immino
Cheto -enolica
Le coppie di basi A:T e G:C hanno lo stesso ingombro trasversale
Gli accoppiamenti causano un accoppiamento antiparallelo
Stabilizzato da fattori entropici
Da impilamento delle basi
Da legami H (specificità)
Incompatibilità A:C
Base flipping Energeticamente facile
Permette l’accesso alle basi per
Metilazione
Rimozione di basi
Verifica complementarietà
Solco maggiore e minore Il solco maggiore offre informazioni:
A: accettore legame H
D: donatore legame H
M: metile
H:idrogeno
A:T ADAM, T:A MADA
G:C AADH, C:G HDAA
Solco minore:
A:T AHA, G:C ADA
Strutture DNA La struttura B è la più comune
La A è più compatta e fatta dall’RNA
La Z è levogira e fatta a Zig-Zag
Conformazioni DNA In soluzione il DNA ha 10.5 bp per giro di elica, assume conformazioni lievemente diverse in base alla sequenza, con torsioni delle basi Nella forma Z il DNA è levogiro. Le purine assumono conformazione anti, invece che sin
È favorita da alti sali
Denaturazione del DNA Bassi sali Alti sali
Topologia del DNA Linking number Lk: numero di volte che un filamento deve essere passato attraverso l’altro per separare le due catene
Twist number Tw: numero di volte che un filamento gira intorno all’altro
Writhe number Wr: numero di incroci dell’asse longitudinale
Lk = Tw + Wr
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